“十一五”期间，为贯彻落实《规划纲要》及其配套政策和《关于改进和加强中央财政科技经费管理若干意见》，不断改进和加强财政科技经费的管理与监督，科技部、财政部会同有关部门对相关科技经费管理政策进行了修改和完善。为便于学习、理解和掌握有关政策和要求，编写了《国家科技计划项目（课题）预算管理问答》。
随着科技投入的不断加大，科技经费管理问题日益为社会各界所关注，各方面提出了很多好的意见和建议。面对“十二五”科技发展新形势、新任务，财政部、科技部共同开展了“十二五”国家科技计划经费管理改革工作，2011年9月，联合印发了《关于调整国家科技计划和公益性行业科研专项经费管理办法若干规定的通知》，进一步明确和规范了当前科技计划经费管理和使用中比较突出的问题，逐步建立了既符合科研活动特点和规律，又符合财政预算管理要求的科研经费管理制度。为便于学习和贯彻执行，两部门有关单位对《国家科技计划项目（课题）预算管理问答》进行了修订，供项目（课题）承担单位和广大科研人员学习参考。